未來世界，人類文明高度發(fā)達(dá)，智能機(jī)器人大量涌現(xiàn)，已在日常生活中占據(jù)重要的位置，而且人類為了獲得永恒的生命，也嘗試將自己改造為機(jī)器人。同時(shí)，一列名為“銀河鐵道999號(hào)”的宇宙列車擔(dān)負(fù)起連接地球和宇宙文明的使命，星系從此不再遙遠(yuǎn)。
　　少年星野鐵郎（野沢雅子 配音）的母親被嗜好殺戮的機(jī)械伯爵殺害，他肩負(fù)母親的囑托，決定前往安達(dá)羅星云改造身體，為此不惜在車站搶奪他人的銀河鐵道999號(hào)車票，不過也因此邂逅了容貌與母親極其相像的梅蒂爾（池田昌子 配音）。憑借梅德爾的幫助，他終于踏上999號(hào)列車，繼而展開一段充滿未知的旅程……
　　本片為《銀河鐵道999》第一部劇場(chǎng)版動(dòng)畫。